Apteka szpitalna realizuje następujące zadania:

1. Organizowanie zaopatrzenia szpitala w produkty lecznicze i wyroby medyczne.
2. Sporządzanie leków recepturowych.
3. Udzielanie informacji dotyczących produktów leczniczych i wyrobów medycznych.
4. Udział w monitorowaniu działań niepożądanych leków.
5. Udział w racjonalizacji farmakoterapii poprzez pracę nad Receptariuszem Szpitalnym w Komitecie Terapeutycznym.
6. Współuczestniczenie w prowadzeniu gospodarki produktami leczniczymi i wyrobami medycznymi w szpitalu.
7. Nadzór nad bezpieczeństwem stosowania produktów leczniczych w szpitalu poprzez informowanie min. o komunikatach wstrzymania i wycofania produktów leczniczych czy także komunikatach bezpieczeństwa.
8. Prowadzenie ewidencji próbek produktów leczniczych, które lekarz może przyjąć i wdrożyć do terapii pacjenta na terenie szpitala.
9. Prowadzenie ewidencji darów produktów leczniczych i wyrobów medycznych wydawanych na oddziały szpitala.